To preto, že pletieš dve veci dokopy. To čo popisuješ je zmena veľkosti dokumentu na hlavnom panely, musíš ísť do nastavení programu Úpravy - predvoľby a tam si nastav Zobrazenie strán - Zväčšenie - podľa šírky (alebo ak chceš 100%, ale nemusíš mať vyplnenú celú obrazovku). Potom skoč hore Dokumenty - Otvoriť nastavenie - Pri ďalšom otváraní dokumentov obnoviť posledné nastavenie zobrazenia.
http://tahaj.sme.sk/software/164?rf=1
Veľa nastavení sa robí už pri vytváraní PDF, má ich v sebe priamo dokument, preto sa niekedy zdá, že prehliadač to otvára "kadejako"

.