Celé je to popísané v ich dokumentácii
Making and restoring your own backup. Na zálohovanie DB sa dá použiť priamo nástroj v administrácii, prípadne akýkoľvek iný spôsob zálohovania DB (napr. odporúčané PhpMyAdmin).
Pri zdrojových kódoch by bolo ideálne, ak by boli udržiavané v nejakom systéme na správu verzií, prípadne postačí aj to čo odporúčajú oni (a teda ftp, ak ide o server, na ktorom je rsync, rozumnejšie by asi bolo použiť rsync, pretože tak by sa sťahovali len zmenené súbory).
